Index

_

__call__() (daart.transforms.BlockShuffle method) (daart.transforms.Compose method) (daart.transforms.MakeOneHot method) (daart.transforms.MotionEnergy method) (daart.transforms.Transform method) (daart.transforms.Unitize method) (daart.transforms.ZScore method)

A

AnnealHparam (class in daart.callbacks)

B

BaseCallback (class in daart.callbacks) BaseModel (class in daart.models.base) BlockShuffle (class in daart.transforms) build_data_generator() (in module daart.utils) build_decoder() (daart.models.tcn.DilatedTCN method) (daart.models.temporalmlp.TemporalMLP method)

build_encoder() (daart.models.tcn.DilatedTCN method) (daart.models.temporalmlp.TemporalMLP method) build_model() (daart.models.base.BaseModel method) (daart.models.base.Segmenter method)

C

clean_tt_dir() (in module daart.testtube) collect_callbacks() (in module daart.utils) Compose (class in daart.transforms)

compute_sequence_pad() (in module daart.data) compute_sequences() (in module daart.data) create_metric_row() (daart.train.Logger method) create_tt_experiment() (in module daart.testtube)

D

daart.callbacks module daart.data module daart.eval module daart.io module daart.losses module daart.models.base module daart.models.rnn module

daart.models.tcn module daart.models.temporalmlp module daart.testtube module daart.train module daart.transforms module daart.utils module DataGenerator (class in daart.data) DilatedTCN (class in daart.models.tcn)

E

EarlyStopping (class in daart.callbacks) Ensembler (class in daart.models.base)

export_expt_info_to_csv() (in module daart.io) export_hparams() (in module daart.io)

F

find_experiment() (in module daart.io) fit() (daart.train.Trainer method) forward() (daart.models.base.BaseModel method) (daart.models.base.Segmenter method) (daart.models.rnn.RNN method) (daart.models.tcn.DilatedTCN method) (daart.models.temporalmlp.TemporalMLP method)

G

get_activation_func_from_str() (in module daart.models.base) get_all_params() (in module daart.testtube) get_expt_dir() (in module daart.io) get_loss() (daart.train.Logger method)

get_model_dir() (in module daart.io) get_model_params() (in module daart.io) get_parameters() (daart.models.base.BaseModel method) get_precision_recall() (in module daart.eval) get_subdirs() (in module daart.io)

I

int_over_union() (in module daart.eval)

K

kl_div_to_std_normal() (in module daart.losses)

L

load_feature_csv() (in module daart.data) load_label_csv() (in module daart.data) load_label_pkl() (in module daart.data) load_marker_csv() (in module daart.data)

load_marker_h5() (in module daart.data) load_metrics_csv_as_df() (in module daart.eval) load_parameters_from_file() (daart.models.base.BaseModel method) Logger (class in daart.train)

M

make_dir_if_not_exists() (in module daart.io) MakeOneHot (class in daart.transforms) module daart.callbacks daart.data daart.eval daart.io daart.losses daart.models.base daart.models.rnn daart.models.tcn daart.models.temporalmlp daart.testtube daart.train daart.transforms daart.utils

MotionEnergy (class in daart.transforms)

N

next_batch() (daart.data.DataGenerator method)

O

on_epoch_end() (daart.callbacks.AnnealHparam method) (daart.callbacks.BaseCallback method) (daart.callbacks.EarlyStopping method) (daart.callbacks.PseudoLabels method) (daart.callbacks.UPS method)

P

plot_training_curves() (in module daart.eval) predict_labels() (daart.models.base.Ensembler method) (daart.models.base.Segmenter method)

print_hparams() (in module daart.testtube) PseudoLabels (class in daart.callbacks)

R

read_expt_info_from_csv() (in module daart.io) reparameterize_gaussian() (in module daart.models.base) reset_iterators() (daart.data.DataGenerator method)

reset_metrics() (daart.train.Logger method) RNN (class in daart.models.rnn) run_lengths() (in module daart.eval)

S

save() (daart.models.base.BaseModel method) Segmenter (class in daart.models.base)

SingleDataset (class in daart.data) split_trials() (in module daart.data)

T

TemporalMLP (class in daart.models.temporalmlp) Trainer (class in daart.train)

training_step() (daart.models.base.BaseModel method) (daart.models.base.Segmenter method) Transform (class in daart.transforms)

U

Unitize (class in daart.transforms)

update_metrics() (daart.train.Logger method) UPS (class in daart.callbacks)

Z

ZScore (class in daart.transforms)